Maraton programistyczny

28-09-2018

Na Wydziale Biologii i Ochrony Środowiska, w dniach 18-20 maja, odbył się pierwszy w Polsce Biohackathon – hackathon bioinformatyczny (BioHack). Był to  maraton programistyczny, podczas którego dziesięć zespołów bioinformatyków, biologów, biotechnologów i informatyków z całego kraju zaprezentowało wyniki swej pracy.

Spotkanie wzbogacone zostało wykładami dr. Bartosza Wilczyńskiego z Polskiego Towarzystwa Bioinformatycznego, prof. Jarosława Dastycha z Proteon Pharmaceuticals, Jana Majty i Giovanniego Mazzocco z firmy Ardigen oraz dr. Dominika Strapagiela z Pracowni Biobank. Część swoich danych genetycznych do prac programistycznych udostępnił Biobank Łódź Uniwersytetu Łódzkiego

Zgodnie z oczekiwaniami współpraca informatyków z biologami zaowocowała ciekawymi rozwiązaniami. Po długich i burzliwych obradach jury ogłoszono wyniki. Pierwsze miejsce zajął zespół białostockich informatyków Slavic specjalizujących się w języku Python, którzy stworzyli, na podstawie algorytmów sztucznej inteligencji, znakomite narzędzia do analiz bakteriofagów. Miejsce drugie zdobył krakowski zespół Kod wawelski, który doskonale poradził sobie z zadaniem przetwarzania danych najbardziej innowacyjnej metody odczytywania sekwencji genetycznej – NGS ( Next Generation Sequencing ), a trzecie – zespół, Eye hackers , który pracował nad problemem przewidywania koloru oczu na podstawie zmienności genetycznej.

x x x

Boost Biotech Polska oraz Biobank Łódź – organizatorzy spotkania – wyrażają nadzieję, iż stanowiło ono znakomitą okazją do wymiany doświadczeń i poszerzenia umiejętności zespołów bioinformatyków, biologów, biotechnologów i informatyków z całej Polski. Podobny „maraton”, z kolejnymi wyzwaniami stawianymi przez naukę, przewidywany jest w następnym roku.

Oprac. (sb)